Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YHR217CYHR217C 462 nt-1.19□□□□□ -2.6
SYF1Q04048 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.2□□□□□ -2.6
SYF1Q04048 snR64snR64 101 nt-1.22□□□□□ -2.6
SYF1Q04048 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.23□□□□□ -2.61
SYF1Q04048 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.25□□□□□ -2.61
SYF1Q04048 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.28□□□□□ -2.61
SYF1Q04048 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.3□□□□□ -2.62
SYF1Q04048 YBL109WYBL109W 336 nt-1.32□□□□□ -2.62
SYF1Q04048 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.36□□□□□ -2.63
SYF1Q04048 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.36□□□□□ -2.63
SYF1Q04048 YOR309CYOR309C 381 nt-1.43□□□□□ -2.64
SYF1Q04048 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.44□□□□□ -2.64
SYF1Q04048 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.47□□□□□ -2.64
SYF1Q04048 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.48□□□□□ -2.65
SYF1Q04048 snR6snR6 112 nt-1.49□□□□□ -2.65
SYF1Q04048 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.52□□□□□ -2.65
SYF1Q04048 snR53snR53 91 nt-1.57□□□□□ -2.66
SYF1Q04048 snR73snR73 106 nt-1.6□□□□□ -2.67
SYF1Q04048 YDR543CYDR543C 300 nt-1.76□□□□□ -2.69
SYF1Q04048 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.76□□□□□ -2.69
SYF1Q04048 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.77□□□□□ -2.69
SYF1Q04048 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.8□□□□□ -2.7
SYF1Q04048 snR40snR40 97 nt-2.03□□□□□ -2.73
SYF1Q04048 snR58snR58 96 nt-2.1□□□□□ -2.75
SYF1Q04048 snR87snR87 109 nt-2.23□□□□□ -2.77
SYF1Q04048 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.33□□□□□ -2.78
SYF1Q04048 snR75snR75 89 nt-2.5□□□□□ -2.81
SYF1Q04048 YJR162CYJR162C 351 nt-2.9□□□□□ -2.87
SYF1Q04048 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.4□□□□□ -2.95
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.9 ms