Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 snR77snR77 88 nt-0.54□□□□□ -2.5
GDE1Q02979 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.56□□□□□ -2.5
GDE1Q02979 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.59□□□□□ -2.5
GDE1Q02979 snR33snR33 183 nt-0.59□□□□□ -2.5
GDE1Q02979 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
GDE1Q02979 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
GDE1Q02979 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
GDE1Q02979 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
GDE1Q02979 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
GDE1Q02979 YNR077CYNR077C 255 nt-0.75□□□□□ -2.53
GDE1Q02979 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.77□□□□□ -2.53
GDE1Q02979 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.88□□□□□ -2.55
GDE1Q02979 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.88□□□□□ -2.55
GDE1Q02979 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.91□□□□□ -2.56
GDE1Q02979 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.94□□□□□ -2.56
GDE1Q02979 snR6snR6 112 nt-0.95□□□□□ -2.56
GDE1Q02979 YOR309CYOR309C 381 nt-1.08□□□□□ -2.58
GDE1Q02979 snR73snR73 106 nt-1.09□□□□□ -2.58
GDE1Q02979 snR40snR40 97 nt-1.12□□□□□ -2.59
GDE1Q02979 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.17□□□□□ -2.6
GDE1Q02979 snR75snR75 89 nt-1.2□□□□□ -2.6
GDE1Q02979 snR58snR58 96 nt-1.5□□□□□ -2.65
GDE1Q02979 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.62□□□□□ -2.67
GDE1Q02979 snR87snR87 109 nt-1.68□□□□□ -2.68
GDE1Q02979 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.81□□□□□ -2.7
GDE1Q02979 YDR543CYDR543C 300 nt-1.98□□□□□ -2.73
GDE1Q02979 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.07□□□□□ -2.74
GDE1Q02979 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.95□□□□□ -2.88
GDE1Q02979 YJR162CYJR162C 351 nt-2.96□□□□□ -2.88
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 152.6 ms