Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms