Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms