Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VldlrP98156 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VldlrP98156 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms