Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll3P85442 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms