Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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