Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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