Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ActbP60710 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ActbP60710 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ActbP60710 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ActbP60710 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ActbP60710 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ActbP60710 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ActbP60710 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ActbP60710 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ActbP60710 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ActbP60710 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ActbP60710 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ActbP60710 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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