Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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