Protein–RNA interactions for Protein: P53330

RTT102, Regulator of Ty1 transposition protein 102, yeastyeast

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT102P53330 Q0092Q0092 141 nt-2.03□□□□□ -2.73
RTT102P53330 Q0143Q0143 153 nt-2.03□□□□□ -2.73
RTT102P53330 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.03□□□□□ -2.73
RTT102P53330 snR6snR6 112 nt-2.05□□□□□ -2.74
RTT102P53330 snR64snR64 101 nt-2.06□□□□□ -2.74
RTT102P53330 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-2.07□□□□□ -2.74
RTT102P53330 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-2.08□□□□□ -2.74
RTT102P53330 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.13□□□□□ -2.75
RTT102P53330 YMR326CYMR326C 309 nt-2.14□□□□□ -2.75
RTT102P53330 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.16□□□□□ -2.76
RTT102P53330 snR85snR85 171 nt-2.17□□□□□ -2.76
RTT102P53330 YHR217CYHR217C 462 nt-2.19□□□□□ -2.76
RTT102P53330 snR73snR73 106 nt-2.25□□□□□ -2.77
RTT102P53330 YDR543CYDR543C 300 nt-2.33□□□□□ -2.78
RTT102P53330 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-2.33□□□□□ -2.78
RTT102P53330 YBL109WYBL109W 336 nt-2.45□□□□□ -2.8
RTT102P53330 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.47□□□□□ -2.8
RTT102P53330 snR53snR53 91 nt-2.52□□□□□ -2.81
RTT102P53330 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.69□□□□□ -2.84
RTT102P53330 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.73□□□□□ -2.85
RTT102P53330 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.74□□□□□ -2.85
RTT102P53330 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-2.75□□□□□ -2.85
RTT102P53330 snR58snR58 96 nt-3.07□□□□□ -2.9
RTT102P53330 snR87snR87 109 nt-3.12□□□□□ -2.91
RTT102P53330 snR40snR40 97 nt-3.12□□□□□ -2.91
RTT102P53330 YJR162CYJR162C 351 nt-3.39□□□□□ -2.95
RTT102P53330 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.42□□□□□ -2.96
RTT102P53330 snR75snR75 89 nt-3.98□□□□□ -3.05
RTT102P53330 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.66□□□□□ -3.16
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 4.1 ms