Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psen1P49769 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psen1P49769 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms