Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox2P48432 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox2P48432 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms