Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gli1P47806 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms