Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms