Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sept1P42209 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sept1P42209 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sept1P42209 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sept1P42209 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms