Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpardP35396 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpardP35396 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpardP35396 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PpardP35396 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpardP35396 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PpardP35396 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PpardP35396 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PpardP35396 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PpardP35396 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpardP35396 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpardP35396 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpardP35396 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms