Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms