Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms