Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc5P32043 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms