Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Saa4P31532 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Saa4P31532 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Saa4P31532 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Saa4P31532 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Saa4P31532 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Saa4P31532 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Saa4P31532 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms