Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa10P31310 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa10P31310 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms