Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msr1P30204 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms