Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd8P29595 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms