Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Hoxd10P28359 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Hoxd10P28359 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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