Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntf3P20181 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms