Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka3P18654 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms