Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd44P15379 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms