Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myf6P15375 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myf6P15375 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms