Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctla2aP12399 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms