Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Timp1P12032 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timp1P12032 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timp1P12032 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms