Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms