Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxb5P09079 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb5P09079 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb5P09079 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb5P09079 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb5P09079 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb5P09079 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb5P09079 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxb5P09079 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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