Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa4P06798 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms