Protein–RNA interactions for Protein: P03987

Ig gamma-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03987 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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P03987 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03987 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03987 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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P03987 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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P03987 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03987 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03987 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P03987 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P03987 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P03987 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P03987 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P03987 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P03987 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P03987 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P03987 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P03987 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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