Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mmp23O88676 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mmp23O88676 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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