Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmx1bO88609 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms