Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms