Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col5a1O88207 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms