Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox6O70238 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms