Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alx3O70137 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alx3O70137 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Alx3O70137 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alx3O70137 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alx3O70137 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms