Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjd2O54851 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjd2O54851 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms