Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zmat3O54836 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zmat3O54836 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms