Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms