Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms