Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms