Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Serpini2-201ENSMUST00000039047 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm21887J3QQ04 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms