Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gm20877J3QPZ4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gm20877J3QPZ4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gm20877J3QPZ4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm20877J3QPZ4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm20877J3QPZ4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20877J3QPZ4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20877J3QPZ4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20877J3QPZ4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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