Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH8

Gm7694, Predicted gene 7694, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7694J3QNH8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7694J3QNH8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm7694J3QNH8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms