Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21060J3KMU4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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